《刺客信条:兄弟会》紧接前作《刺客信条II》，酒保DesmondMiles与其余三名现代刺客（LucyStillman,ShuanHastings,RebeccaCrane）在逃离跨国制药公司Abstergo（现代圣殿骑士团）的追击后到达意大利城市蒙特里久尼。以已荒废的Auditore庄园地下室作为新的藏身之所，Desmond再次使用